MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli E24377A chromosome

Total Repeats: 102245

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009801	TG	3	6	37	42	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009801	A	7	7	47	53	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009801	AGC	2	6	65	70	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_009801	CAGA	2	8	156	163	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009801	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_009801	CAC	2	6	204	209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_009801	ACC	3	9	214	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_009801	A	6	6	274	279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009801	T	8	8	302	309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009801	AAC	2	6	329	334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009801	CGG	2	6	353	358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157158747
12	NC_009801	CAGG	2	8	419	426	25 %	0 %	50 %	25 %	157158747
13	NC_009801	CT	3	6	444	449	0 %	50 %	0 %	50 %	157158747
14	NC_009801	ACCA	2	8	465	472	50 %	0 %	0 %	50 %	157158747
15	NC_009801	TGG	2	6	475	480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157158747
16	NC_009801	GAT	2	6	482	487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157158747
17	NC_009801	A	6	6	490	495	100 %	0 %	0 %	0 %	157158747
18	NC_009801	CCG	2	6	571	576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157158747
19	NC_009801	TCG	2	6	613	618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157158747
20	NC_009801	TTG	2	6	663	668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157158747
21	NC_009801	CGCTG	2	10	692	701	0 %	20 %	40 %	40 %	157158747
22	NC_009801	ACT	2	6	794	799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157158747
23	NC_009801	CCG	2	6	848	853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157158747
24	NC_009801	CCG	2	6	907	912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157158747
25	NC_009801	TGG	2	6	931	936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157158747
26	NC_009801	ACT	2	6	958	963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157158747
27	NC_009801	CGG	2	6	967	972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157158747
28	NC_009801	GCTG	2	8	974	981	0 %	25 %	50 %	25 %	157158747
29	NC_009801	TTG	2	6	998	1003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157158747
30	NC_009801	GGAC	2	8	1012	1019	25 %	0 %	50 %	25 %	157158747
31	NC_009801	GTT	2	6	1067	1072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157158747
32	NC_009801	TTC	2	6	1126	1131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157158747
33	NC_009801	TGA	2	6	1232	1237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157158747
34	NC_009801	GGC	2	6	1328	1333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157158747
35	NC_009801	GC	3	6	1332	1337	0 %	0 %	50 %	50 %	157158747
36	NC_009801	GTG	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157158747
37	NC_009801	ATC	2	6	1388	1393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157158747
38	NC_009801	TG	3	6	1434	1439	0 %	50 %	50 %	0 %	157158747
39	NC_009801	AAG	2	6	1483	1488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157158747
40	NC_009801	GGT	2	6	1535	1540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157158747
41	NC_009801	TCT	2	6	1635	1640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157158747
42	NC_009801	GAT	2	6	1671	1676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157158747
43	NC_009801	TCA	2	6	1700	1705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157158747
44	NC_009801	GCT	2	6	1772	1777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157158747
45	NC_009801	CAA	2	6	1794	1799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157158747
46	NC_009801	GCTG	2	8	1801	1808	0 %	25 %	50 %	25 %	157158747
47	NC_009801	GAA	2	6	1902	1907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157158747
48	NC_009801	ATC	2	6	1966	1971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157158747
49	NC_009801	TTG	2	6	1987	1992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157158747
50	NC_009801	CCAG	2	8	2002	2009	25 %	0 %	25 %	50 %	157158747
51	NC_009801	CTT	2	6	2033	2038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157158747
52	NC_009801	TCG	2	6	2085	2090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157158747
53	NC_009801	TAC	2	6	2097	2102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157158747
54	NC_009801	GCG	2	6	2118	2123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157158747
55	NC_009801	TGA	2	6	2213	2218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157158747
56	NC_009801	TGA	2	6	2221	2226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157158747
57	NC_009801	ACT	2	6	2304	2309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157158747
58	NC_009801	GAT	2	6	2349	2354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157158747
59	NC_009801	ATTGAA	2	12	2430	2441	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	157158747
60	NC_009801	TGC	2	6	2446	2451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157158747
61	NC_009801	CGA	2	6	2510	2515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157158747
62	NC_009801	CG	4	8	2525	2532	0 %	0 %	50 %	50 %	157158747
63	NC_009801	TGA	2	6	2546	2551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157158747
64	NC_009801	TGA	2	6	2582	2587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157158747
65	NC_009801	TGCC	2	8	2594	2601	0 %	25 %	25 %	50 %	157158747
66	NC_009801	TAT	2	6	2685	2690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157158747
67	NC_009801	TGC	2	6	2707	2712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157158747
68	NC_009801	GCG	2	6	2863	2868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157158096
69	NC_009801	GGC	2	6	2916	2921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157158096
70	NC_009801	CAA	2	6	2937	2942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157158096
71	NC_009801	GCAA	2	8	3029	3036	50 %	0 %	25 %	25 %	157158096
72	NC_009801	GGT	2	6	3105	3110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157158096
73	NC_009801	ATGA	2	8	3127	3134	50 %	25 %	25 %	0 %	157158096
74	NC_009801	GCA	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157158096
75	NC_009801	TGG	2	6	3243	3248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157158096
76	NC_009801	TGA	2	6	3257	3262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157158096
77	NC_009801	GAA	2	6	3265	3270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157158096
78	NC_009801	CAT	2	6	3276	3281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157158096
79	NC_009801	CAGC	2	8	3282	3289	25 %	0 %	25 %	50 %	157158096
80	NC_009801	TGA	2	6	3303	3308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157158096
81	NC_009801	CGC	2	6	3385	3390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157158096
82	NC_009801	ATTGC	2	10	3395	3404	20 %	40 %	20 %	20 %	157158096
83	NC_009801	CTGG	2	8	3418	3425	0 %	25 %	50 %	25 %	157158096
84	NC_009801	TTCA	2	8	3427	3434	25 %	50 %	0 %	25 %	157158096
85	NC_009801	TGA	2	6	3473	3478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157158096
86	NC_009801	AGCG	2	8	3564	3571	25 %	0 %	50 %	25 %	157158096
87	NC_009801	TCCGGC	2	12	3577	3588	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	157158096
88	NC_009801	CGG	2	6	3704	3709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157158096
89	NC_009801	T	6	6	3820	3825	0 %	100 %	0 %	0 %	157157451
90	NC_009801	CTGA	2	8	3850	3857	25 %	25 %	25 %	25 %	157157451
91	NC_009801	TGA	2	6	3861	3866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157157451
92	NC_009801	TGA	2	6	3924	3929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157157451
93	NC_009801	GC	3	6	3960	3965	0 %	0 %	50 %	50 %	157157451
94	NC_009801	CGG	2	6	4059	4064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157157451
95	NC_009801	GGC	2	6	4252	4257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157157451
96	NC_009801	TGA	3	9	4323	4331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157157451
97	NC_009801	CTA	2	6	4404	4409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157157451
98	NC_009801	GC	3	6	4441	4446	0 %	0 %	50 %	50 %	157157451
99	NC_009801	CGG	2	6	4493	4498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157157451
100	NC_009801	CTG	2	6	4501	4506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157157451
101	NC_009801	TGC	2	6	4542	4547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157157451
102	NC_009801	ACG	2	6	4583	4588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157157451
103	NC_009801	AAC	2	6	4651	4656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157157451
104	NC_009801	GTT	2	6	4674	4679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157157451
105	NC_009801	CCG	2	6	4680	4685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157157451
106	NC_009801	GAT	2	6	4726	4731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157157451
107	NC_009801	AG	3	6	4881	4886	50 %	0 %	50 %	0 %	157157451
108	NC_009801	CCG	2	6	4973	4978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157157451
109	NC_009801	TGC	2	6	4983	4988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157157451
110	NC_009801	TGA	3	9	5000	5008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157157451
111	NC_009801	ATC	2	6	5009	5014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157157451
112	NC_009801	T	6	6	5070	5075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009801	GAA	2	6	5078	5083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009801	AAC	2	6	5162	5167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_009801	CGT	2	6	5168	5173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_009801	TTA	2	6	5361	5366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157156558
117	NC_009801	TGG	2	6	5398	5403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157156558
118	NC_009801	ACA	2	6	5406	5411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157156558
119	NC_009801	CCG	2	6	5449	5454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157156558
120	NC_009801	CCG	2	6	5458	5463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157156558
121	NC_009801	TCA	2	6	5481	5486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157156558
122	NC_009801	ATC	2	6	5489	5494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157156558
123	NC_009801	CGG	2	6	5496	5501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157156558
124	NC_009801	TAT	2	6	5600	5605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157156558
125	NC_009801	CTGC	2	8	5639	5646	0 %	25 %	25 %	50 %	157156558
126	NC_009801	GGTT	2	8	5776	5783	0 %	50 %	50 %	0 %	157156558
127	NC_009801	GTC	2	6	5865	5870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157156183
128	NC_009801	A	6	6	5879	5884	100 %	0 %	0 %	0 %	157156183
129	NC_009801	GCTG	2	8	5922	5929	0 %	25 %	50 %	25 %	157156183
130	NC_009801	GTCA	2	8	6028	6035	25 %	25 %	25 %	25 %	157156183
131	NC_009801	GC	3	6	6104	6109	0 %	0 %	50 %	50 %	157156183
132	NC_009801	GTC	2	6	6126	6131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157156183
133	NC_009801	CG	3	6	6173	6178	0 %	0 %	50 %	50 %	157156183
134	NC_009801	CCA	2	6	6199	6204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157156183
135	NC_009801	GAT	2	6	6347	6352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157156183
136	NC_009801	CTG	2	6	6377	6382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157156183
137	NC_009801	GA	3	6	6402	6407	50 %	0 %	50 %	0 %	157156183
138	NC_009801	CGC	2	6	6472	6477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157156183
139	NC_009801	CCA	2	6	6597	6602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157156183
140	NC_009801	GGC	2	6	6640	6645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157156183
141	NC_009801	GAAAG	2	10	6655	6664	60 %	0 %	40 %	0 %	157156183
142	NC_009801	GAT	2	6	6679	6684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157156183
143	NC_009801	GCG	2	6	6761	6766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157156183
144	NC_009801	A	7	7	6787	6793	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009801	A	6	6	6849	6854	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009801	AT	3	6	6891	6896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009801	CGC	2	6	6935	6940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_009801	GCT	2	6	6966	6971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157155229
149	NC_009801	GGA	2	6	7003	7008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157155229
150	NC_009801	TCA	2	6	7013	7018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157155229
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152	NC_009801	CAGT	2	8	7044	7051	25 %	25 %	25 %	25 %	157155229
153	NC_009801	AAT	2	6	7078	7083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157155229
154	NC_009801	TCA	2	6	7092	7097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157155229
155	NC_009801	TGA	2	6	7125	7130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157155229
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157	NC_009801	TTC	2	6	7190	7195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157155229
158	NC_009801	CAC	2	6	7237	7242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157155229
159	NC_009801	TGC	2	6	7255	7260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157155229
160	NC_009801	TTG	2	6	7277	7282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157155229
161	NC_009801	TGA	2	6	7284	7289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157155229
162	NC_009801	AAATCG	2	12	7430	7441	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	157155229
163	NC_009801	AGCG	2	8	7548	7555	25 %	0 %	50 %	25 %	157155229
164	NC_009801	CTG	2	6	7639	7644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157155229
165	NC_009801	GTG	2	6	7679	7684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157155229
166	NC_009801	A	7	7	7774	7780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_009801	CAT	2	6	7821	7826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157154855
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176	NC_009801	GCCA	2	8	8505	8512	25 %	0 %	25 %	50 %	157154855
177	NC_009801	TTA	2	6	8562	8567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157154855
178	NC_009801	CAG	2	6	8665	8670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157154855
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180	NC_009801	CG	3	6	8832	8837	0 %	0 %	50 %	50 %	157154855
181	NC_009801	CGG	2	6	8979	8984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157154855
182	NC_009801	CG	3	6	9024	9029	0 %	0 %	50 %	50 %	157154855
183	NC_009801	CAA	2	6	9158	9163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157154855
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186	NC_009801	AAG	2	6	9297	9302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
187	NC_009801	TA	3	6	9303	9308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_009801	GGCG	2	8	9365	9372	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
189	NC_009801	CGG	2	6	9429	9434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
190	NC_009801	CGT	2	6	9449	9454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
191	NC_009801	ATC	2	6	9458	9463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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195	NC_009801	CGCAG	2	10	9638	9647	20 %	0 %	40 %	40 %	157158697
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199	NC_009801	CAG	2	6	9717	9722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157158697
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213	NC_009801	CTGT	2	8	10518	10525	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
214	NC_009801	TGA	2	6	10582	10587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157158038
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221	NC_009801	CGTAC	2	10	11066	11075	20 %	20 %	20 %	40 %	157158038
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223	NC_009801	A	7	7	11170	11176	100 %	0 %	0 %	0 %	157158038
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225	NC_009801	G	6	6	11188	11193	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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238	NC_009801	ATC	3	9	11785	11793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
239	NC_009801	GAAT	2	8	11794	11801	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
240	NC_009801	AAT	2	6	11807	11812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
241	NC_009801	ATA	2	6	11848	11853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
242	NC_009801	GAAAAT	2	12	11891	11902	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
243	NC_009801	GCAG	2	8	11950	11957	25 %	0 %	50 %	25 %	157156853
244	NC_009801	GCA	2	6	12061	12066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157156853
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247	NC_009801	TCA	2	6	12166	12171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157156853
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251	NC_009801	CCA	2	6	12411	12416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157156853
252	NC_009801	GCG	2	6	12452	12457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157156853
253	NC_009801	CATT	2	8	12628	12635	25 %	50 %	0 %	25 %	157156853
254	NC_009801	T	6	6	12634	12639	0 %	100 %	0 %	0 %	157156853
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258	NC_009801	GGC	2	6	12837	12842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157157943
259	NC_009801	AG	3	6	12891	12896	50 %	0 %	50 %	0 %	157157943
260	NC_009801	GCA	2	6	13008	13013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157157943
261	NC_009801	GGAT	2	8	13094	13101	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
262	NC_009801	CTG	2	6	13115	13120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
263	NC_009801	AGA	2	6	13127	13132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
264	NC_009801	TTA	2	6	13156	13161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
265	NC_009801	T	6	6	13165	13170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
266	NC_009801	ATTC	2	8	13190	13197	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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